Localisation des stations de contrôle des poissons migrateurs, sur le bassin hydrographique de la Loire.Le réseau des stations de contrôle (STACOMI), qui sont généralement situées au niveau des dispositifs de franchissement, permet de contrôler la migration des espèces à la montaison et/ou à la dévalaison via un comptage vidéo ou un dispositif de piègeage.Ce comptage permet d'estimer les stocks de migrateurs pour un bassin versant donné et renseigne sur l'état sanitaire des populations ainsi que sur leurs flux migratoires. Il contribue également à l'évaluation de l'efficacité du dispositif de franchissement.Le réseau de ces stations de contrôle permet donc de renseigner sur l'état qualitatif et quantitatif des populations de poissons migrateurs et leurs flux migratoires.
Un suivi par pêches électriques des juvéniles de saumon de l’année, aussi appelés tacons 0+, est réalisé chaque année sur plus d’une centaine de stations réparties sur les bassins de l’Allier et de la Gartempe. Ces pêches de sondage sont réalisées sur des radiers (habitats spécifiques aux juvéniles de saumon de l’année) selon un protocole standardisé qui permet d’obtenir un indice d’abondance pour 5 minutes de pêche effective (Prevost et Baglinière, 1995). Ces pêches annuelles permettent de connaître le succès de la reproduction en estimant la production naturelle de juvéniles, d’évaluer la survie des juvéniles déversés au stade alevin et de vérifier la fonctionnalité des zones favorables aux juvéniles.
La quantité et la qualité des habitats augmentent les chances de survies des poissons migrateurs. Ainsi, les cartographies des zones d’accueil ou la validation de l’utilisation de ces espaces permet de mesurer les enjeux de territoires et la priorisation de la restauration. Les faciès d’écoulement dominants et accessoires sont identifiés par prospection à pied et décrits selon le protocole Malavoi et Souchon 2001. Leur linéaire est numérisé par superposition avec une orthophotographie. Le jeu de données inclut tous les linéaires de faciès décrits dans le cadre d'opérations menées par ou en collaboration avec LOGRAMI sur le Bassin versant de la Loire.